但是和兵法，武术不同的是，忍术有他的独特性.忍术发达的地区有以下几处忍术的流派也就是用以下的地名当作流派的名称：武藏，甲斐，越后，信浓，等四州
忍术在日本共有49个流派，其中甲贺与伊贺知名度最高。在古代，各个流派在各个地域为了不同的主君而奋斗着，当然他们的所做所为从来都是秘密
每个流派都拥有着各自政治，忍术的独特性，分化性。
其中青森的中川流在后三州时期从默默无闻瞬间变的富强，忍者军事力量在当时超越了甲贺流与服部流，当然事出必有因。
后三州战国时期的忍界，有一种特编制忍者部队，被称为奇忍，顾名思义就是拥有奇特力量的忍者，其中有一类奇忍的能力最为突出“瞳术”无论在侦察，实战中使用“瞳术”的奇忍功绩卓绝，存活率极高。分别有：羽黑流的[显瞳]，服部流的[轮瞳]，伊贺流的[白瞳]，秋叶流的[力瞳]，中川流的[流瞳]。
后三州时代的五瞳。
[显瞳](对应＜＜火影忍者＞＞中的写轮眼)
血红色的眼睛，其瞳孔可自如收缩，可大幅度远距离观察到敌人的动态，在战斗中有预测敌人行动的超能力，对其意志虚弱，体力下降的敌人可施展幻术，用眼睛摧残敌人致死。
[轮瞳](对应＜＜火影忍者＞＞中的轮回眼)
服部流杀人于无形的利器，后三州时代服部流拥有[轮瞳]的奇忍都出自一个家族，称为迁叶，族人门从出生就拥有心意相通的能力，在实战中他们利用瞳术特性可互相传递彼此的讯息来赢得胜利，族群也极为团结，在当时服部流中是威望最高的一族，流派对其十分依赖。
[白瞳](对应＜＜火影忍者＞＞中的白眼)致敌以千里之外的jing妙瞳术，出于伊贺流的炙雨族，但其能力只遗传女儒，在伊贺流女性地位是很低的，不能参与军事，炙雨族在当时是以针灸而闻名，后被胜村将军发现其族的特殊能力，破例收编训练了10名女忍。在与甲贺流的忍战中，炙雨族女忍使用特制的弓箭（轻盈威力小射程远），配合瞳术及针灸能力，对人体**位的jing确判断，杀敌于无形，战功卓绝。其雪，白的双眼，被后人称之“雪忍”
[力瞳](对应＜＜火影忍者＞＞中的万花筒写轮眼)
秋叶流内乱时，一伙乱民集团首领“正村一夫”拥有的瞳术，靠自身的意志，发挥其瞳力，瞬间获得强大的力量，施展瞳术时眼睛呈全黑色，双目流血，战役后正村虽亡，但获得一骑当千之美誉。
[流瞳](对应＜＜火影忍者＞＞中的鸣人的眼睛)
青森一带被誉为神之族的风魔一族所拥有，眼睛呈碧绿色，施术时瞳孔成旋涡状，可瞬间获得无比的体力，传说悟性高的族人还能创造出另一个心境，不受任何幻术影响。
后三州战国末期，伊贺大举进攻中川时，风魔一族的天才菊石丸，受父令，以一招家族秘技“风魔手里剑”缓和了战势。一战成名，被后人所传诵，万夫莫敌“风魔小次郎”。
瞳术的种类很多，有“速读”、“催眠”、“占卜”等，此术在现实生活中确实存在，这种术形式多样，很难掌握，稍有失误就会造成个中不良后果。简单的说就是用人的瞳孔所发挥出的超能力，属于瞳术。
目前能用瞳术看见未来的人不在少数，会有瞬间的感应得知将要发生的事情的瞬间画面，这样的感应多在儿童身上所能有体会。当有些孩子对父母说出不可理喻的话时，多部分家长会当做没发生的来欺骗孩子的感情，实际上大家可以回忆一下，是不是有好多事情都是你小时候觉得奇怪但没人告知结果所以导致后来的思想模糊呢？
开发全脑思想也是有瞳术的功劳，可以用瞳孔探知自己的潜在能力，或者挖掘能量，这属于科学，一种还没有办法用科学解释出来的科学，而所有科学最早都没有适当的解释，重在于大家对其的开发与探索。
速读是训练人脑用最快速度看书，然后记下来，我练的是瞳术中的“据点扩散”也就是说，把书放远，就例如一张白纸，你看的是整个纸，吸收了整个画面，记下。再在白纸上点一个黑点，指尖大小，这时再把白纸拿给你，你看的是什么？